пятница, 21 февраля 2014 г.

Гиперметилирование ДНК гемопоэтических стволовых клеток в культуре in vitro

Гемопоэтические стволовые и прогениторные клетки (ГСК/ГПК) могут поддерживаться в культуре in vitro, однако большая часть их потомства теряет стволовость в течение культивирования. В этом исследовании авторы сравнили профили метилирования ДНК свежеизолированных ГСК/ГПК и той же популяции клеток после экспансии.

Условия культивирования CD34+ клеток - в присутствии мезенхимальных стромальных клеток (МСК) и без них - оказывали относительно небольшое влияние на метилирование ДНК, хотя пролиферация значительно усиливалась при использовании стромальной подложки. Однако все культивированные ГСК/ГПК, в том числе те, которые сохранили экспрессию CD34+, приобрели выраженное гиперметилирование ДНК. В частности гиперметилирование наблюдалось в upstream промоторных областях, в так называемых берегах CpG островков, в сайтах связывания PU.1, HOXA5 и RUNX1. Это отражалось на дифференциальной экспрессии генов и различных транскриптах DNMT3A. Низкие концентрации ингибиторов метилирования ДНК незначительно увеличивали относительное количество клеток, дающих начало колониеобразующим единицам. 

Полученные результаты показывают, что гемопоэтические стволовые и прогениторные клетки приобретают гиперметилирование ДНК в специфических сайтах генома, которые имеют значение для быстрой потери стволовости во время манипуляций in vitro.

Литература


Weidner CI, Walenda T, Lin Q, Wölfler MM, Denecke B, Costa IG, Zenke M, Wagner W. Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Acquire Distinct DNA-Hypermethylation During in vitro Culture. Sci Rep. 2013 Nov 28;3:3372. 


Комментариев нет:

Отправить комментарий